Abstract

In imaging modalities recording diffraction data, such as the imaging of viruses at X-ray free electron laser facilities, the original image can be reconstructed assuming known phases. When phases are unknown, oversampling and a constraint on the support region in the original object can be used to solve a non-convex optimization problem using iterative alternating-projection methods. Such schemes are ill-suited for finding the optimum solution for sparse data, since the recorded pattern does not correspond exactly to the original wave function. Different iteration starting points can give rise to different solutions. We construct a convex optimization problem, where the only local optimum is also the global optimum. This is achieved using a modified support constraint and a maximum-likelihood treatment of the recorded data as a sample from the underlying wave function. This relaxed problem is solved in order to provide a new set of most probable “healed” signal intensities, without sparseness and missing data. For these new intensities, it should be possible to satisfy the support constraint and intensity constraint exactly, without conflicts between them. By making both constraints satisfiable, traditional phase retrieval with superior results is made possible. On simulated data, we demonstrate the benefits of our approach visually, and quantify the improvement in terms of the crystallographic R factor for the recovered scalar amplitudes relative to true simulations from .405 to .097, as well as the mean-squared error in the reconstructed image from .233 to .139. We also compare our approach, with regards to theory and simulation results, to other approaches for healing as well as noise-tolerant phase retrieval. These tests indicate that the COACS pre-processing allows for best-in-class results.

© 2018 Optical Society of America under the terms of the OSA Open Access Publishing Agreement

Full Article  |  PDF Article
OSA Recommended Articles
Improved bounds on object support from autocorrelation support and application to phase retrieval

T. R. Crimmins, J. R. Fienup, and B. J. Thelen
J. Opt. Soc. Am. A 7(1) 3-13 (1990)

Solving large-scale general phase retrieval problems via a sequence of convex relaxations

Reinier Doelman, Nguyen H. Thao, and Michel Verhaegen
J. Opt. Soc. Am. A 35(8) 1410-1419 (2018)

Iterative phase retrieval without support

J. S. Wu, U. Weierstall, J. C. H. Spence, and C. T. Koch
Opt. Lett. 29(23) 2737-2739 (2004)

References

  • View by:
  • |
  • |
  • |

  1. P. D. Adams, P. V. Afonine, R. W. Grosse-Kunstleve, R. J. Read, J. S. Richardson, D. C. Richardson, and T. C. Terwilliger, “Recent developments in phasing and structure refinement for macromolecular crystallography,” Curr. Opin. Struct. Biol. 19, 566–572 (2009).
    [Crossref] [PubMed]
  2. J. Miao, T. Ishikawa, E. H. Anderson, and K. O. Hodgson, “Phase retrieval of diffraction patterns from noncrystalline samples using the oversampling method,” Phys. Rev. B 67, 174104 (2003).
    [Crossref]
  3. J. Miao, D. Sayre, and H. Chapman, “Phase retrieval from the magnitude of the Fourier transforms of nonperiodic objects,” J. Opt. Soc. Am. A 15, 1662–1669 (1998).
    [Crossref]
  4. J. R. Fienup, “Phase retrieval algorithms: a comparison,” Appl. Opt. 21, 2758–2769 (1982).
    [Crossref] [PubMed]
  5. D. R. Luke, “Relaxed averaged alternating reflections for diffraction imaging,” Inverse Probl. 21, 37–50 (2004).
    [Crossref]
  6. S. Marchesini, “Invited article: A unified evaluation of iterative projection algorithms for phase retrieval,” Rev. Sci. Instruments 78, 011301 (2007).
    [Crossref]
  7. S. Boutet and G. J. Williams, “The coherent X-ray imaging (CXI) instrument at the Linac Coherent Light Source (LCLS),” New J. Phys. 12, 035024 (2010).
    [Crossref]
  8. A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).
  9. H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
    [Crossref]
  10. M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
    [Crossref] [PubMed]
  11. M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
    [Crossref]
  12. E. J. Candes, T. Strohmer, and V. Voroninski, “Phaselift: Exact and stable signal recovery from magnitude measurements via convex programming,” Commun. on Pure Appl. Math. 66, 1241–1274 (2013).
    [Crossref]
  13. E. J. Candes, Y. C. Eldar, T. Strohmer, and V. Voroninski, “Phase retrieval via matrix completion,” SIAM Rev. 57, 225–251 (2015).
    [Crossref]
  14. I. Waldspurger, A. d’Aspremont, and S. Mallat, “Phase recovery, maxcut and complex semidefinite programming,” Math. Program. 149, 47–81 (2015).
    [Crossref]
  15. A. E. Yagle, “Non-iterative phase retrieval from magnitude of complex-valued compact-support images,” Tech. rep., University of Michigan (2009).
  16. K. Huang, Y. C. Eldar, and N. D. Sidiropoulos, “Phase retrieval from 1D fourier measurements: Convexity, uniqueness, and algorithms,” IEEE Transactions on Signal Process. 64, 6105–6117 (2016).
    [Crossref]
  17. S. R. Becker, E. J. Candès, and M. C. Grant, “Templates for convex cone problems with applications to sparse signal recovery,” Math. Program. Comput. 3, 165–218 (2011).
    [Crossref]
  18. N.-T. D. Loh, S. Eisebitt, S. Flewett, and V. Elser, “Recovering magnetization distributions from their noisy diffraction data,” Phys. Rev. E 82, 061128 (2010).
    [Crossref]
  19. J. A. Rodriguez, R. Xu, C.-C. Chen, Y. Zou, and J. Miao, “Oversampling smoothness: an effective algorithm for phase retrieval of noisy diffraction intensities,” J. Appl. Crystallogr. 46, 312–318 (2013).
    [Crossref] [PubMed]
  20. T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
    [Crossref] [PubMed]
  21. R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
    [Crossref] [PubMed]
  22. A. Hosseinizadeh, G. Mashayekhi, J. Copperman, P. Schwander, A. Dashti, R. Sepehr, R. Fung, M. Schmidt, C. H. Yoon, B. G. Hogue, G. J. Williams, A. Aquila, and A. Ourmazd, “Conformational landscape of a virus by single-particle x-ray scattering,” Nat. Methods 14, 877–881 (2017).
    [Crossref] [PubMed]
  23. K. S. Raines, S. Salha, R. L. Sandberg, H. Jiang, J. A. Rodríguez, B. P. Fahimian, H. C. Kapteyn, J. Du, and J. Miao, “Three-dimensional structure determination from a single view,” Nature 463, 214 (2010).
    [Crossref]
  24. A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
    [Crossref]
  25. F. R. Maia, T. Ekeberg, D. Van Der Spoel, and J. Hajdu, “Hawk: the image reconstruction package for coherent x-ray diffractive imaging,” J. Appl. Crystallogr. 43, 1535–1539 (2010).
    [Crossref]
  26. P. Thibault, V. Elser, C. Jacobsen, D. Shapiro, and D. Sayre, “Reconstruction of a yeast cell from x-ray diffraction data,” Acta Crystallogr. A 62, 248–261 (2006).
    [Crossref] [PubMed]
  27. L. Shi, G. Wetzstein, and T. J. Lane, “A flexible phase retrieval framework for flux-limited coherent x-ray imaging,” arXiv preprint arXiv:1606.01195 (2016).
  28. V. Elser, T.-Y. Lan, and T. Bendory, “Benchmark problems for phase retrieval,” arXiv preprint arXiv:1706.00399 (2017).
  29. Y. Shechtman, Y. C. Eldar, O. Cohen, H. N. Chapman, J. Miao, and M. Segev, “Phase retrieval with application to optical imaging: a contemporary overview,” IEEE Signal Process. Mag. 32, 87–109 (2015).
    [Crossref]
  30. Y. Nesterov, Introductory Lectures on Convex Optimization: A Basic Course, vol. 87 (Springer Science & Business Media, 2013).
  31. J. Löfberg, “YALMIP: A toolbox for modeling and optimization in MATLAB,” in Computer Aided Control Systems Design, 2004 IEEE International Symposium on, (IEEE, 2004), pp. 284–289.
    [Crossref]
  32. MOSEK ApS, The MOSEK Optimization Toolbox for MATLAB Manual. Version 8.1. (2017).
  33. M. Grant, S. Boyd, and Y. Ye, “CVX: Matlab software for disciplined convex programming,” (2008).
  34. D. Slepian, “Prolate spheroidal wave functions, fourier analysis, and uncertainty—V: The discrete case,” Bell Syst. Tech. J. 57, 1371–1430 (1978).
    [Crossref]
  35. P. Thibault, V. Elser, C. Jacobsen, D. Shapiro, and D. Sayre, “Reconstruction of a yeast cell from x-ray diffraction data,” Acta Crystallogr. A 62, 248–261 (2006).
    [Crossref] [PubMed]
  36. B. Leshem, R. Xu, Y. Dallal, J. Miao, B. Nadler, D. Oron, N. Dudovich, and O. Raz, “Direct single-shot phase retrieval from the diffraction pattern of separated objects,” Nat. Commun. 7, 10820 (2016).
    [Crossref] [PubMed]
  37. C. F. Bohren and D. R. Huffman, Absorption and Scattering of Light by Small Particles (Wiley-Blackwell, 2007), chap. 4, pp. 82–129.
    [Crossref]
  38. S. Becker, E. Candes, and M. Grant, Templates for First-Order Conic Solvers User Guide 1.3 (2013).
  39. M. F. Hantke, T. Ekeberg, and F. R. Maia, “Condor: a simulation tool for flash x-ray imaging,” J. Appl. Crystallogr. 49, 1356–1362 (2016).
    [Crossref] [PubMed]
  40. S. Marchesini, H. He, H. N. Chapman, S. P. Hau-Riege, A. Noy, M. R. Howells, U. Weierstall, and J. C. Spence, “X-ray image reconstruction from a diffraction pattern alone,” Phys. Rev. B 68, 140101 (2003).
    [Crossref]
  41. S. Marchesini, H. Chapman, A. Barty, C. Cui, M. Howells, J. Spence, U. Weierstall, and A. Minor, “Phase aberrations in diffraction microscopy,” arXiv preprint physics/0510033 (2005).
  42. Y. Rivenson, Y. Zhang, H. Günaydın, D. Teng, and A. Ozcan, “Phase recovery and holographic image reconstruction using deep learning in neural networks,” Light. Sci. & Appl. 7, 17141 (2018).
    [Crossref]

2018 (1)

Y. Rivenson, Y. Zhang, H. Günaydın, D. Teng, and A. Ozcan, “Phase recovery and holographic image reconstruction using deep learning in neural networks,” Light. Sci. & Appl. 7, 17141 (2018).
[Crossref]

2017 (2)

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

A. Hosseinizadeh, G. Mashayekhi, J. Copperman, P. Schwander, A. Dashti, R. Sepehr, R. Fung, M. Schmidt, C. H. Yoon, B. G. Hogue, G. J. Williams, A. Aquila, and A. Ourmazd, “Conformational landscape of a virus by single-particle x-ray scattering,” Nat. Methods 14, 877–881 (2017).
[Crossref] [PubMed]

2016 (3)

K. Huang, Y. C. Eldar, and N. D. Sidiropoulos, “Phase retrieval from 1D fourier measurements: Convexity, uniqueness, and algorithms,” IEEE Transactions on Signal Process. 64, 6105–6117 (2016).
[Crossref]

B. Leshem, R. Xu, Y. Dallal, J. Miao, B. Nadler, D. Oron, N. Dudovich, and O. Raz, “Direct single-shot phase retrieval from the diffraction pattern of separated objects,” Nat. Commun. 7, 10820 (2016).
[Crossref] [PubMed]

M. F. Hantke, T. Ekeberg, and F. R. Maia, “Condor: a simulation tool for flash x-ray imaging,” J. Appl. Crystallogr. 49, 1356–1362 (2016).
[Crossref] [PubMed]

2015 (5)

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

Y. Shechtman, Y. C. Eldar, O. Cohen, H. N. Chapman, J. Miao, and M. Segev, “Phase retrieval with application to optical imaging: a contemporary overview,” IEEE Signal Process. Mag. 32, 87–109 (2015).
[Crossref]

E. J. Candes, Y. C. Eldar, T. Strohmer, and V. Voroninski, “Phase retrieval via matrix completion,” SIAM Rev. 57, 225–251 (2015).
[Crossref]

I. Waldspurger, A. d’Aspremont, and S. Mallat, “Phase recovery, maxcut and complex semidefinite programming,” Math. Program. 149, 47–81 (2015).
[Crossref]

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

2014 (1)

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

2013 (2)

E. J. Candes, T. Strohmer, and V. Voroninski, “Phaselift: Exact and stable signal recovery from magnitude measurements via convex programming,” Commun. on Pure Appl. Math. 66, 1241–1274 (2013).
[Crossref]

J. A. Rodriguez, R. Xu, C.-C. Chen, Y. Zou, and J. Miao, “Oversampling smoothness: an effective algorithm for phase retrieval of noisy diffraction intensities,” J. Appl. Crystallogr. 46, 312–318 (2013).
[Crossref] [PubMed]

2011 (3)

S. R. Becker, E. J. Candès, and M. C. Grant, “Templates for convex cone problems with applications to sparse signal recovery,” Math. Program. Comput. 3, 165–218 (2011).
[Crossref]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

2010 (4)

S. Boutet and G. J. Williams, “The coherent X-ray imaging (CXI) instrument at the Linac Coherent Light Source (LCLS),” New J. Phys. 12, 035024 (2010).
[Crossref]

N.-T. D. Loh, S. Eisebitt, S. Flewett, and V. Elser, “Recovering magnetization distributions from their noisy diffraction data,” Phys. Rev. E 82, 061128 (2010).
[Crossref]

K. S. Raines, S. Salha, R. L. Sandberg, H. Jiang, J. A. Rodríguez, B. P. Fahimian, H. C. Kapteyn, J. Du, and J. Miao, “Three-dimensional structure determination from a single view,” Nature 463, 214 (2010).
[Crossref]

F. R. Maia, T. Ekeberg, D. Van Der Spoel, and J. Hajdu, “Hawk: the image reconstruction package for coherent x-ray diffractive imaging,” J. Appl. Crystallogr. 43, 1535–1539 (2010).
[Crossref]

2009 (1)

P. D. Adams, P. V. Afonine, R. W. Grosse-Kunstleve, R. J. Read, J. S. Richardson, D. C. Richardson, and T. C. Terwilliger, “Recent developments in phasing and structure refinement for macromolecular crystallography,” Curr. Opin. Struct. Biol. 19, 566–572 (2009).
[Crossref] [PubMed]

2007 (1)

S. Marchesini, “Invited article: A unified evaluation of iterative projection algorithms for phase retrieval,” Rev. Sci. Instruments 78, 011301 (2007).
[Crossref]

2006 (3)

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

P. Thibault, V. Elser, C. Jacobsen, D. Shapiro, and D. Sayre, “Reconstruction of a yeast cell from x-ray diffraction data,” Acta Crystallogr. A 62, 248–261 (2006).
[Crossref] [PubMed]

P. Thibault, V. Elser, C. Jacobsen, D. Shapiro, and D. Sayre, “Reconstruction of a yeast cell from x-ray diffraction data,” Acta Crystallogr. A 62, 248–261 (2006).
[Crossref] [PubMed]

2004 (1)

D. R. Luke, “Relaxed averaged alternating reflections for diffraction imaging,” Inverse Probl. 21, 37–50 (2004).
[Crossref]

2003 (2)

S. Marchesini, H. He, H. N. Chapman, S. P. Hau-Riege, A. Noy, M. R. Howells, U. Weierstall, and J. C. Spence, “X-ray image reconstruction from a diffraction pattern alone,” Phys. Rev. B 68, 140101 (2003).
[Crossref]

J. Miao, T. Ishikawa, E. H. Anderson, and K. O. Hodgson, “Phase retrieval of diffraction patterns from noncrystalline samples using the oversampling method,” Phys. Rev. B 67, 174104 (2003).
[Crossref]

1998 (1)

1982 (1)

1978 (1)

D. Slepian, “Prolate spheroidal wave functions, fourier analysis, and uncertainty—V: The discrete case,” Bell Syst. Tech. J. 57, 1371–1430 (1978).
[Crossref]

Abergel, C.

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Adams, P. D.

P. D. Adams, P. V. Afonine, R. W. Grosse-Kunstleve, R. J. Read, J. S. Richardson, D. C. Richardson, and T. C. Terwilliger, “Recent developments in phasing and structure refinement for macromolecular crystallography,” Curr. Opin. Struct. Biol. 19, 566–572 (2009).
[Crossref] [PubMed]

Adolph, M.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Afonine, P. V.

P. D. Adams, P. V. Afonine, R. W. Grosse-Kunstleve, R. J. Read, J. S. Richardson, D. C. Richardson, and T. C. Terwilliger, “Recent developments in phasing and structure refinement for macromolecular crystallography,” Curr. Opin. Struct. Biol. 19, 566–572 (2009).
[Crossref] [PubMed]

Anderson, E. H.

J. Miao, T. Ishikawa, E. H. Anderson, and K. O. Hodgson, “Phase retrieval of diffraction patterns from noncrystalline samples using the oversampling method,” Phys. Rev. B 67, 174104 (2003).
[Crossref]

Andersson, I.

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Andreasson, J.

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Andritschke, R.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Aquila, A.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

A. Hosseinizadeh, G. Mashayekhi, J. Copperman, P. Schwander, A. Dashti, R. Sepehr, R. Fung, M. Schmidt, C. H. Yoon, B. G. Hogue, G. J. Williams, A. Aquila, and A. Ourmazd, “Conformational landscape of a virus by single-particle x-ray scattering,” Nat. Methods 14, 877–881 (2017).
[Crossref] [PubMed]

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Bajt, S.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Barends, T. R. M.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Barthelmess, M.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Barty, A.

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

S. Marchesini, H. Chapman, A. Barty, C. Cui, M. Howells, J. Spence, U. Weierstall, and A. Minor, “Phase aberrations in diffraction microscopy,” arXiv preprint physics/0510033 (2005).

Becker, S.

S. Becker, E. Candes, and M. Grant, Templates for First-Order Conic Solvers User Guide 1.3 (2013).

Becker, S. R.

S. R. Becker, E. J. Candès, and M. C. Grant, “Templates for convex cone problems with applications to sparse signal recovery,” Math. Program. Comput. 3, 165–218 (2011).
[Crossref]

Bendory, T.

V. Elser, T.-Y. Lan, and T. Bendory, “Benchmark problems for phase retrieval,” arXiv preprint arXiv:1706.00399 (2017).

Benner, H.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Benner, W. H.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Bergh, M.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Berntsen, P.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Bielecki, J.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Bogan, M. J.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Bohren, C. F.

C. F. Bohren and D. R. Huffman, Absorption and Scattering of Light by Small Particles (Wiley-Blackwell, 2007), chap. 4, pp. 82–129.
[Crossref]

Bostedt, C.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Bott, M.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Boutet, S.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

S. Boutet and G. J. Williams, “The coherent X-ray imaging (CXI) instrument at the Linac Coherent Light Source (LCLS),” New J. Phys. 12, 035024 (2010).
[Crossref]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Boyd, S.

M. Grant, S. Boyd, and Y. Ye, “CVX: Matlab software for disciplined convex programming,” (2008).

Bozek, J. D.

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Bucksbaum, P.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Caleman, C.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Candes, E.

S. Becker, E. Candes, and M. Grant, Templates for First-Order Conic Solvers User Guide 1.3 (2013).

Candes, E. J.

E. J. Candes, Y. C. Eldar, T. Strohmer, and V. Voroninski, “Phase retrieval via matrix completion,” SIAM Rev. 57, 225–251 (2015).
[Crossref]

E. J. Candes, T. Strohmer, and V. Voroninski, “Phaselift: Exact and stable signal recovery from magnitude measurements via convex programming,” Commun. on Pure Appl. Math. 66, 1241–1274 (2013).
[Crossref]

Candès, E. J.

S. R. Becker, E. J. Candès, and M. C. Grant, “Templates for convex cone problems with applications to sparse signal recovery,” Math. Program. Comput. 3, 165–218 (2011).
[Crossref]

Carini, G.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

Carlsson, G. H.

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

Carron, S.

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

Chapman, H.

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

J. Miao, D. Sayre, and H. Chapman, “Phase retrieval from the magnitude of the Fourier transforms of nonperiodic objects,” J. Opt. Soc. Am. A 15, 1662–1669 (1998).
[Crossref]

S. Marchesini, H. Chapman, A. Barty, C. Cui, M. Howells, J. Spence, U. Weierstall, and A. Minor, “Phase aberrations in diffraction microscopy,” arXiv preprint physics/0510033 (2005).

Chapman, H. N.

Y. Shechtman, Y. C. Eldar, O. Cohen, H. N. Chapman, J. Miao, and M. Segev, “Phase retrieval with application to optical imaging: a contemporary overview,” IEEE Signal Process. Mag. 32, 87–109 (2015).
[Crossref]

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

S. Marchesini, H. He, H. N. Chapman, S. P. Hau-Riege, A. Noy, M. R. Howells, U. Weierstall, and J. C. Spence, “X-ray image reconstruction from a diffraction pattern alone,” Phys. Rev. B 68, 140101 (2003).
[Crossref]

Chen, C.-C.

J. A. Rodriguez, R. Xu, C.-C. Chen, Y. Zou, and J. Miao, “Oversampling smoothness: an effective algorithm for phase retrieval of noisy diffraction intensities,” J. Appl. Crystallogr. 46, 312–318 (2013).
[Crossref] [PubMed]

Claverie, J.-M.

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

Claverie, J.-M. M.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Cohen, O.

Y. Shechtman, Y. C. Eldar, O. Cohen, H. N. Chapman, J. Miao, and M. Segev, “Phase retrieval with application to optical imaging: a contemporary overview,” IEEE Signal Process. Mag. 32, 87–109 (2015).
[Crossref]

Copperman, J.

A. Hosseinizadeh, G. Mashayekhi, J. Copperman, P. Schwander, A. Dashti, R. Sepehr, R. Fung, M. Schmidt, C. H. Yoon, B. G. Hogue, G. J. Williams, A. Aquila, and A. Ourmazd, “Conformational landscape of a virus by single-particle x-ray scattering,” Nat. Methods 14, 877–881 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Coppola, N.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Cui, C.

S. Marchesini, H. Chapman, A. Barty, C. Cui, M. Howells, J. Spence, U. Weierstall, and A. Minor, “Phase aberrations in diffraction microscopy,” arXiv preprint physics/0510033 (2005).

d’Aspremont, A.

I. Waldspurger, A. d’Aspremont, and S. Mallat, “Phase recovery, maxcut and complex semidefinite programming,” Math. Program. 149, 47–81 (2015).
[Crossref]

Dallal, Y.

B. Leshem, R. Xu, Y. Dallal, J. Miao, B. Nadler, D. Oron, N. Dudovich, and O. Raz, “Direct single-shot phase retrieval from the diffraction pattern of separated objects,” Nat. Commun. 7, 10820 (2016).
[Crossref] [PubMed]

Dashti, A.

A. Hosseinizadeh, G. Mashayekhi, J. Copperman, P. Schwander, A. Dashti, R. Sepehr, R. Fung, M. Schmidt, C. H. Yoon, B. G. Hogue, G. J. Williams, A. Aquila, and A. Ourmazd, “Conformational landscape of a virus by single-particle x-ray scattering,” Nat. Methods 14, 877–881 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Daurer, B. J.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

DeMirci, H.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

dePonte, D.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

DePonte, D. P.

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Doak, R. B.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Donatelli, J. J.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Doniach, S.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

Downing, K. H.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

Drell, P.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

Du, J.

K. S. Raines, S. Salha, R. L. Sandberg, H. Jiang, J. A. Rodríguez, B. P. Fahimian, H. C. Kapteyn, J. Du, and J. Miao, “Three-dimensional structure determination from a single view,” Nature 463, 214 (2010).
[Crossref]

Dudovich, N.

B. Leshem, R. Xu, Y. Dallal, J. Miao, B. Nadler, D. Oron, N. Dudovich, and O. Raz, “Direct single-shot phase retrieval from the diffraction pattern of separated objects,” Nat. Commun. 7, 10820 (2016).
[Crossref] [PubMed]

Duesterer, S.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Earnest, T.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

Eisebitt, S.

N.-T. D. Loh, S. Eisebitt, S. Flewett, and V. Elser, “Recovering magnetization distributions from their noisy diffraction data,” Phys. Rev. E 82, 061128 (2010).
[Crossref]

Ekeberg, T.

M. F. Hantke, T. Ekeberg, and F. R. Maia, “Condor: a simulation tool for flash x-ray imaging,” J. Appl. Crystallogr. 49, 1356–1362 (2016).
[Crossref] [PubMed]

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

F. R. Maia, T. Ekeberg, D. Van Der Spoel, and J. Hajdu, “Hawk: the image reconstruction package for coherent x-ray diffractive imaging,” J. Appl. Crystallogr. 43, 1535–1539 (2010).
[Crossref]

Eldar, Y. C.

K. Huang, Y. C. Eldar, and N. D. Sidiropoulos, “Phase retrieval from 1D fourier measurements: Convexity, uniqueness, and algorithms,” IEEE Transactions on Signal Process. 64, 6105–6117 (2016).
[Crossref]

E. J. Candes, Y. C. Eldar, T. Strohmer, and V. Voroninski, “Phase retrieval via matrix completion,” SIAM Rev. 57, 225–251 (2015).
[Crossref]

Y. Shechtman, Y. C. Eldar, O. Cohen, H. N. Chapman, J. Miao, and M. Segev, “Phase retrieval with application to optical imaging: a contemporary overview,” IEEE Signal Process. Mag. 32, 87–109 (2015).
[Crossref]

Elmlund, H.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

Elser, V.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

N.-T. D. Loh, S. Eisebitt, S. Flewett, and V. Elser, “Recovering magnetization distributions from their noisy diffraction data,” Phys. Rev. E 82, 061128 (2010).
[Crossref]

P. Thibault, V. Elser, C. Jacobsen, D. Shapiro, and D. Sayre, “Reconstruction of a yeast cell from x-ray diffraction data,” Acta Crystallogr. A 62, 248–261 (2006).
[Crossref] [PubMed]

P. Thibault, V. Elser, C. Jacobsen, D. Shapiro, and D. Sayre, “Reconstruction of a yeast cell from x-ray diffraction data,” Acta Crystallogr. A 62, 248–261 (2006).
[Crossref] [PubMed]

V. Elser, T.-Y. Lan, and T. Bendory, “Benchmark problems for phase retrieval,” arXiv preprint arXiv:1706.00399 (2017).

Epp, S.

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

Epp, S. W.

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Erk, B.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Fahimian, B. P.

K. S. Raines, S. Salha, R. L. Sandberg, H. Jiang, J. A. Rodríguez, B. P. Fahimian, H. C. Kapteyn, J. Du, and J. Miao, “Three-dimensional structure determination from a single view,” Nature 463, 214 (2010).
[Crossref]

Farquar, G. R.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Ferguson, K.

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

Ferguson, K. R.

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

Fienup, J. R.

Fleckenstein, H.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Flewett, S.

N.-T. D. Loh, S. Eisebitt, S. Flewett, and V. Elser, “Recovering magnetization distributions from their noisy diffraction data,” Phys. Rev. E 82, 061128 (2010).
[Crossref]

Foucar, L.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Frank, M.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Fromme, P.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Fung, R.

A. Hosseinizadeh, G. Mashayekhi, J. Copperman, P. Schwander, A. Dashti, R. Sepehr, R. Fung, M. Schmidt, C. H. Yoon, B. G. Hogue, G. J. Williams, A. Aquila, and A. Ourmazd, “Conformational landscape of a virus by single-particle x-ray scattering,” Nat. Methods 14, 877–881 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Gorke, H.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Gorkhover, T.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Graafsma, H.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Grant, M.

M. Grant, S. Boyd, and Y. Ye, “CVX: Matlab software for disciplined convex programming,” (2008).

S. Becker, E. Candes, and M. Grant, Templates for First-Order Conic Solvers User Guide 1.3 (2013).

Grant, M. C.

S. R. Becker, E. J. Candès, and M. C. Grant, “Templates for convex cone problems with applications to sparse signal recovery,” Math. Program. Comput. 3, 165–218 (2011).
[Crossref]

Grosse-Kunstleve, R. W.

P. D. Adams, P. V. Afonine, R. W. Grosse-Kunstleve, R. J. Read, J. S. Richardson, D. C. Richardson, and T. C. Terwilliger, “Recent developments in phasing and structure refinement for macromolecular crystallography,” Curr. Opin. Struct. Biol. 19, 566–572 (2009).
[Crossref] [PubMed]

Gühr, M.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

Gumprecht, L.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Günaydin, H.

Y. Rivenson, Y. Zhang, H. Günaydın, D. Teng, and A. Ozcan, “Phase recovery and holographic image reconstruction using deep learning in neural networks,” Light. Sci. & Appl. 7, 17141 (2018).
[Crossref]

Hajdu, J.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

F. R. Maia, T. Ekeberg, D. Van Der Spoel, and J. Hajdu, “Hawk: the image reconstruction package for coherent x-ray diffractive imaging,” J. Appl. Crystallogr. 43, 1535–1539 (2010).
[Crossref]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Hampton, C. Y.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Hantke, M.

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Hantke, M. F.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

M. F. Hantke, T. Ekeberg, and F. R. Maia, “Condor: a simulation tool for flash x-ray imaging,” J. Appl. Crystallogr. 49, 1356–1362 (2016).
[Crossref] [PubMed]

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

Hartmann, A.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Hartmann, E.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Hartmann, R.

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Hasse, D.

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

Hastings, J.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

Hau-Riege, S. P.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

S. Marchesini, H. He, H. N. Chapman, S. P. Hau-Riege, A. Noy, M. R. Howells, U. Weierstall, and J. C. Spence, “X-ray image reconstruction from a diffraction pattern alone,” Phys. Rev. B 68, 140101 (2003).
[Crossref]

Hauser, G.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

He, H.

S. Marchesini, H. He, H. N. Chapman, S. P. Hau-Riege, A. Noy, M. R. Howells, U. Weierstall, and J. C. Spence, “X-ray image reconstruction from a diffraction pattern alone,” Phys. Rev. B 68, 140101 (2003).
[Crossref]

Herrmann, S.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Hirsemann, H.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Hodgson, K. O.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

J. Miao, T. Ishikawa, E. H. Anderson, and K. O. Hodgson, “Phase retrieval of diffraction patterns from noncrystalline samples using the oversampling method,” Phys. Rev. B 67, 174104 (2003).
[Crossref]

Hoemke, A.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Hoener, M.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Hogue, B. G.

A. Hosseinizadeh, G. Mashayekhi, J. Copperman, P. Schwander, A. Dashti, R. Sepehr, R. Fung, M. Schmidt, C. H. Yoon, B. G. Hogue, G. J. Williams, A. Aquila, and A. Ourmazd, “Conformational landscape of a virus by single-particle x-ray scattering,” Nat. Methods 14, 877–881 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Holl, P.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Hömke, A.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Hosseinizadeh, A.

A. Hosseinizadeh, G. Mashayekhi, J. Copperman, P. Schwander, A. Dashti, R. Sepehr, R. Fung, M. Schmidt, C. H. Yoon, B. G. Hogue, G. J. Williams, A. Aquila, and A. Ourmazd, “Conformational landscape of a virus by single-particle x-ray scattering,” Nat. Methods 14, 877–881 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Howells, M.

S. Marchesini, H. Chapman, A. Barty, C. Cui, M. Howells, J. Spence, U. Weierstall, and A. Minor, “Phase aberrations in diffraction microscopy,” arXiv preprint physics/0510033 (2005).

Howells, M. R.

S. Marchesini, H. He, H. N. Chapman, S. P. Hau-Riege, A. Noy, M. R. Howells, U. Weierstall, and J. C. Spence, “X-ray image reconstruction from a diffraction pattern alone,” Phys. Rev. B 68, 140101 (2003).
[Crossref]

Huang, K.

K. Huang, Y. C. Eldar, and N. D. Sidiropoulos, “Phase retrieval from 1D fourier measurements: Convexity, uniqueness, and algorithms,” IEEE Transactions on Signal Process. 64, 6105–6117 (2016).
[Crossref]

Huang, Z.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

Huffman, D. R.

C. F. Bohren and D. R. Huffman, Absorption and Scattering of Light by Small Particles (Wiley-Blackwell, 2007), chap. 4, pp. 82–129.
[Crossref]

Huldt, G.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Hunter, M.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Ingelman, M.

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

Ishikawa, T.

J. Miao, T. Ishikawa, E. H. Anderson, and K. O. Hodgson, “Phase retrieval of diffraction patterns from noncrystalline samples using the oversampling method,” Phys. Rev. B 67, 174104 (2003).
[Crossref]

Iwan, B.

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Jacobsen, C.

P. Thibault, V. Elser, C. Jacobsen, D. Shapiro, and D. Sayre, “Reconstruction of a yeast cell from x-ray diffraction data,” Acta Crystallogr. A 62, 248–261 (2006).
[Crossref] [PubMed]

P. Thibault, V. Elser, C. Jacobsen, D. Shapiro, and D. Sayre, “Reconstruction of a yeast cell from x-ray diffraction data,” Acta Crystallogr. A 62, 248–261 (2006).
[Crossref] [PubMed]

Jiang, H.

K. S. Raines, S. Salha, R. L. Sandberg, H. Jiang, J. A. Rodríguez, B. P. Fahimian, H. C. Kapteyn, J. Du, and J. Miao, “Three-dimensional structure determination from a single view,” Nature 463, 214 (2010).
[Crossref]

John, K.

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

Jönsson, O.

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Kapteyn, H. C.

K. S. Raines, S. Salha, R. L. Sandberg, H. Jiang, J. A. Rodríguez, B. P. Fahimian, H. C. Kapteyn, J. Du, and J. Miao, “Three-dimensional structure determination from a single view,” Nature 463, 214 (2010).
[Crossref]

Kassemeyer, S.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Kimmel, N.

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Kirian, R.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Kirian, R. A.

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

Kiskinova, M.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Krasniqi, F.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Krzywinski, J.

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Kuhlmann, M.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Kühnel, K.-U. U.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Kurta, R. P.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Lan, T.-Y.

V. Elser, T.-Y. Lan, and T. Bendory, “Benchmark problems for phase retrieval,” arXiv preprint arXiv:1706.00399 (2017).

Lane, T. J.

L. Shi, G. Wetzstein, and T. J. Lane, “A flexible phase retrieval framework for flux-limited coherent x-ray imaging,” arXiv preprint arXiv:1606.01195 (2016).

Larsson, D. S.

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

Lattman, E. E.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

Lee, R. W.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Leshem, B.

B. Leshem, R. Xu, Y. Dallal, J. Miao, B. Nadler, D. Oron, N. Dudovich, and O. Raz, “Direct single-shot phase retrieval from the diffraction pattern of separated objects,” Nat. Commun. 7, 10820 (2016).
[Crossref] [PubMed]

Liang, M.

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Löfberg, J.

J. Löfberg, “YALMIP: A toolbox for modeling and optimization in MATLAB,” in Computer Aided Control Systems Design, 2004 IEEE International Symposium on, (IEEE, 2004), pp. 284–289.
[Crossref]

Loh, N. D.

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

Loh, N.-T. D.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

N.-T. D. Loh, S. Eisebitt, S. Flewett, and V. Elser, “Recovering magnetization distributions from their noisy diffraction data,” Phys. Rev. E 82, 061128 (2010).
[Crossref]

Lomb, L.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

London, R. A.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Luke, D. R.

D. R. Luke, “Relaxed averaged alternating reflections for diffraction imaging,” Inverse Probl. 21, 37–50 (2004).
[Crossref]

Maia, F.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Maia, F. R.

M. F. Hantke, T. Ekeberg, and F. R. Maia, “Condor: a simulation tool for flash x-ray imaging,” J. Appl. Crystallogr. 49, 1356–1362 (2016).
[Crossref] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

F. R. Maia, T. Ekeberg, D. Van Der Spoel, and J. Hajdu, “Hawk: the image reconstruction package for coherent x-ray diffractive imaging,” J. Appl. Crystallogr. 43, 1535–1539 (2010).
[Crossref]

Maia, F. R. N. C.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Mallat, S.

I. Waldspurger, A. d’Aspremont, and S. Mallat, “Phase recovery, maxcut and complex semidefinite programming,” Math. Program. 149, 47–81 (2015).
[Crossref]

Mancuso, A. P.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Marchesini, S.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

S. Marchesini, “Invited article: A unified evaluation of iterative projection algorithms for phase retrieval,” Rev. Sci. Instruments 78, 011301 (2007).
[Crossref]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

S. Marchesini, H. He, H. N. Chapman, S. P. Hau-Riege, A. Noy, M. R. Howells, U. Weierstall, and J. C. Spence, “X-ray image reconstruction from a diffraction pattern alone,” Phys. Rev. B 68, 140101 (2003).
[Crossref]

S. Marchesini, H. Chapman, A. Barty, C. Cui, M. Howells, J. Spence, U. Weierstall, and A. Minor, “Phase aberrations in diffraction microscopy,” arXiv preprint physics/0510033 (2005).

Martin, A.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Martin, A. V.

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Mashayekhi, G.

A. Hosseinizadeh, G. Mashayekhi, J. Copperman, P. Schwander, A. Dashti, R. Sepehr, R. Fung, M. Schmidt, C. H. Yoon, B. G. Hogue, G. J. Williams, A. Aquila, and A. Ourmazd, “Conformational landscape of a virus by single-particle x-ray scattering,” Nat. Methods 14, 877–881 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Messerschmidt, M.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Miahnahri, A. A.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Miao, J.

B. Leshem, R. Xu, Y. Dallal, J. Miao, B. Nadler, D. Oron, N. Dudovich, and O. Raz, “Direct single-shot phase retrieval from the diffraction pattern of separated objects,” Nat. Commun. 7, 10820 (2016).
[Crossref] [PubMed]

Y. Shechtman, Y. C. Eldar, O. Cohen, H. N. Chapman, J. Miao, and M. Segev, “Phase retrieval with application to optical imaging: a contemporary overview,” IEEE Signal Process. Mag. 32, 87–109 (2015).
[Crossref]

J. A. Rodriguez, R. Xu, C.-C. Chen, Y. Zou, and J. Miao, “Oversampling smoothness: an effective algorithm for phase retrieval of noisy diffraction intensities,” J. Appl. Crystallogr. 46, 312–318 (2013).
[Crossref] [PubMed]

K. S. Raines, S. Salha, R. L. Sandberg, H. Jiang, J. A. Rodríguez, B. P. Fahimian, H. C. Kapteyn, J. Du, and J. Miao, “Three-dimensional structure determination from a single view,” Nature 463, 214 (2010).
[Crossref]

J. Miao, T. Ishikawa, E. H. Anderson, and K. O. Hodgson, “Phase retrieval of diffraction patterns from noncrystalline samples using the oversampling method,” Phys. Rev. B 67, 174104 (2003).
[Crossref]

J. Miao, D. Sayre, and H. Chapman, “Phase retrieval from the magnitude of the Fourier transforms of nonperiodic objects,” J. Opt. Soc. Am. A 15, 1662–1669 (1998).
[Crossref]

Minor, A.

S. Marchesini, H. Chapman, A. Barty, C. Cui, M. Howells, J. Spence, U. Weierstall, and A. Minor, “Phase aberrations in diffraction microscopy,” arXiv preprint physics/0510033 (2005).

Moeller, T.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Mühlig, K.

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

Munke, A.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Nadler, B.

B. Leshem, R. Xu, Y. Dallal, J. Miao, B. Nadler, D. Oron, N. Dudovich, and O. Raz, “Direct single-shot phase retrieval from the diffraction pattern of separated objects,” Nat. Commun. 7, 10820 (2016).
[Crossref] [PubMed]

Nass, K.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Nesterov, Y.

Y. Nesterov, Introductory Lectures on Convex Optimization: A Basic Course, vol. 87 (Springer Science & Business Media, 2013).

Nettelblad, C.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

Nilsson, B.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Noy, A.

S. Marchesini, H. He, H. N. Chapman, S. P. Hau-Riege, A. Noy, M. R. Howells, U. Weierstall, and J. C. Spence, “X-ray image reconstruction from a diffraction pattern alone,” Phys. Rev. B 68, 140101 (2003).
[Crossref]

Odic, D.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Oron, D.

B. Leshem, R. Xu, Y. Dallal, J. Miao, B. Nadler, D. Oron, N. Dudovich, and O. Raz, “Direct single-shot phase retrieval from the diffraction pattern of separated objects,” Nat. Commun. 7, 10820 (2016).
[Crossref] [PubMed]

Ourmazd, A.

A. Hosseinizadeh, G. Mashayekhi, J. Copperman, P. Schwander, A. Dashti, R. Sepehr, R. Fung, M. Schmidt, C. H. Yoon, B. G. Hogue, G. J. Williams, A. Aquila, and A. Ourmazd, “Conformational landscape of a virus by single-particle x-ray scattering,” Nat. Methods 14, 877–881 (2017).
[Crossref] [PubMed]

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

Ozcan, A.

Y. Rivenson, Y. Zhang, H. Günaydın, D. Teng, and A. Ozcan, “Phase recovery and holographic image reconstruction using deep learning in neural networks,” Light. Sci. & Appl. 7, 17141 (2018).
[Crossref]

Pande, K.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Pedersoli, E.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Pellegrini, C.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

Pietschner, D.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Ploenjes, E.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Potdevin, G.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Raines, K. S.

K. S. Raines, S. Salha, R. L. Sandberg, H. Jiang, J. A. Rodríguez, B. P. Fahimian, H. C. Kapteyn, J. Du, and J. Miao, “Three-dimensional structure determination from a single view,” Nature 463, 214 (2010).
[Crossref]

Raz, O.

B. Leshem, R. Xu, Y. Dallal, J. Miao, B. Nadler, D. Oron, N. Dudovich, and O. Raz, “Direct single-shot phase retrieval from the diffraction pattern of separated objects,” Nat. Commun. 7, 10820 (2016).
[Crossref] [PubMed]

Read, R. J.

P. D. Adams, P. V. Afonine, R. W. Grosse-Kunstleve, R. J. Read, J. S. Richardson, D. C. Richardson, and T. C. Terwilliger, “Recent developments in phasing and structure refinement for macromolecular crystallography,” Curr. Opin. Struct. Biol. 19, 566–572 (2009).
[Crossref] [PubMed]

Reddy, H. K. N.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Reich, C.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Richardson, D. C.

P. D. Adams, P. V. Afonine, R. W. Grosse-Kunstleve, R. J. Read, J. S. Richardson, D. C. Richardson, and T. C. Terwilliger, “Recent developments in phasing and structure refinement for macromolecular crystallography,” Curr. Opin. Struct. Biol. 19, 566–572 (2009).
[Crossref] [PubMed]

Richardson, J. S.

P. D. Adams, P. V. Afonine, R. W. Grosse-Kunstleve, R. J. Read, J. S. Richardson, D. C. Richardson, and T. C. Terwilliger, “Recent developments in phasing and structure refinement for macromolecular crystallography,” Curr. Opin. Struct. Biol. 19, 566–572 (2009).
[Crossref] [PubMed]

Rivenson, Y.

Y. Rivenson, Y. Zhang, H. Günaydın, D. Teng, and A. Ozcan, “Phase recovery and holographic image reconstruction using deep learning in neural networks,” Light. Sci. & Appl. 7, 17141 (2018).
[Crossref]

Rocker, A.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Rodriguez, J. A.

J. A. Rodriguez, R. Xu, C.-C. Chen, Y. Zou, and J. Miao, “Oversampling smoothness: an effective algorithm for phase retrieval of noisy diffraction intensities,” J. Appl. Crystallogr. 46, 312–318 (2013).
[Crossref] [PubMed]

Rodríguez, J. A.

K. S. Raines, S. Salha, R. L. Sandberg, H. Jiang, J. A. Rodríguez, B. P. Fahimian, H. C. Kapteyn, J. Du, and J. Miao, “Three-dimensional structure determination from a single view,” Nature 463, 214 (2010).
[Crossref]

Rolles, D.

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Rudek, B.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Rudenko, A.

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Rupp, D.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Salha, S.

K. S. Raines, S. Salha, R. L. Sandberg, H. Jiang, J. A. Rodríguez, B. P. Fahimian, H. C. Kapteyn, J. Du, and J. Miao, “Three-dimensional structure determination from a single view,” Nature 463, 214 (2010).
[Crossref]

Sandberg, R. L.

K. S. Raines, S. Salha, R. L. Sandberg, H. Jiang, J. A. Rodríguez, B. P. Fahimian, H. C. Kapteyn, J. Du, and J. Miao, “Three-dimensional structure determination from a single view,” Nature 463, 214 (2010).
[Crossref]

Santra, R.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

Sayre, D.

P. Thibault, V. Elser, C. Jacobsen, D. Shapiro, and D. Sayre, “Reconstruction of a yeast cell from x-ray diffraction data,” Acta Crystallogr. A 62, 248–261 (2006).
[Crossref] [PubMed]

P. Thibault, V. Elser, C. Jacobsen, D. Shapiro, and D. Sayre, “Reconstruction of a yeast cell from x-ray diffraction data,” Acta Crystallogr. A 62, 248–261 (2006).
[Crossref] [PubMed]

J. Miao, D. Sayre, and H. Chapman, “Phase retrieval from the magnitude of the Fourier transforms of nonperiodic objects,” J. Opt. Soc. Am. A 15, 1662–1669 (1998).
[Crossref]

Schaller, G.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Schlichting, I.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Schmidt, C.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Schmidt, M.

A. Hosseinizadeh, G. Mashayekhi, J. Copperman, P. Schwander, A. Dashti, R. Sepehr, R. Fung, M. Schmidt, C. H. Yoon, B. G. Hogue, G. J. Williams, A. Aquila, and A. Ourmazd, “Conformational landscape of a virus by single-particle x-ray scattering,” Nat. Methods 14, 877–881 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Schneider, J. R.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Schopper, F.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Schorb, S.

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Schroer, C.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

Schröter, C.-D. D.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Schultz, J.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Schulz, J.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Schwander, P.

A. Hosseinizadeh, G. Mashayekhi, J. Copperman, P. Schwander, A. Dashti, R. Sepehr, R. Fung, M. Schmidt, C. H. Yoon, B. G. Hogue, G. J. Williams, A. Aquila, and A. Ourmazd, “Conformational landscape of a virus by single-particle x-ray scattering,” Nat. Methods 14, 877–881 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Segev, M.

Y. Shechtman, Y. C. Eldar, O. Cohen, H. N. Chapman, J. Miao, and M. Segev, “Phase retrieval with application to optical imaging: a contemporary overview,” IEEE Signal Process. Mag. 32, 87–109 (2015).
[Crossref]

Seibert, M.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Seibert, M. M.

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Sellberg, J. A.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Seltzer, V.

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Sepehr, R.

A. Hosseinizadeh, G. Mashayekhi, J. Copperman, P. Schwander, A. Dashti, R. Sepehr, R. Fung, M. Schmidt, C. H. Yoon, B. G. Hogue, G. J. Williams, A. Aquila, and A. Ourmazd, “Conformational landscape of a virus by single-particle x-ray scattering,” Nat. Methods 14, 877–881 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Shapiro, D.

P. Thibault, V. Elser, C. Jacobsen, D. Shapiro, and D. Sayre, “Reconstruction of a yeast cell from x-ray diffraction data,” Acta Crystallogr. A 62, 248–261 (2006).
[Crossref] [PubMed]

P. Thibault, V. Elser, C. Jacobsen, D. Shapiro, and D. Sayre, “Reconstruction of a yeast cell from x-ray diffraction data,” Acta Crystallogr. A 62, 248–261 (2006).
[Crossref] [PubMed]

Shapiro, D. A.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Shechtman, Y.

Y. Shechtman, Y. C. Eldar, O. Cohen, H. N. Chapman, J. Miao, and M. Segev, “Phase retrieval with application to optical imaging: a contemporary overview,” IEEE Signal Process. Mag. 32, 87–109 (2015).
[Crossref]

Shi, L.

L. Shi, G. Wetzstein, and T. J. Lane, “A flexible phase retrieval framework for flux-limited coherent x-ray imaging,” arXiv preprint arXiv:1606.01195 (2016).

Shoeman, R. L.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Sidiropoulos, N. D.

K. Huang, Y. C. Eldar, and N. D. Sidiropoulos, “Phase retrieval from 1D fourier measurements: Convexity, uniqueness, and algorithms,” IEEE Transactions on Signal Process. 64, 6105–6117 (2016).
[Crossref]

Sierra, R. G.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Slepian, D.

D. Slepian, “Prolate spheroidal wave functions, fourier analysis, and uncertainty—V: The discrete case,” Bell Syst. Tech. J. 57, 1371–1430 (1978).
[Crossref]

Soltau, H.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Spence, J.

S. Marchesini, H. Chapman, A. Barty, C. Cui, M. Howells, J. Spence, U. Weierstall, and A. Minor, “Phase aberrations in diffraction microscopy,” arXiv preprint physics/0510033 (2005).

Spence, J. C.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

S. Marchesini, H. He, H. N. Chapman, S. P. Hau-Riege, A. Noy, M. R. Howells, U. Weierstall, and J. C. Spence, “X-ray image reconstruction from a diffraction pattern alone,” Phys. Rev. B 68, 140101 (2003).
[Crossref]

Spence, J. C. H.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

Spiller, E.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Starodub, D.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Steinbrener, J.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Stellato, F.

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Stern, S.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Strohmer, T.

E. J. Candes, Y. C. Eldar, T. Strohmer, and V. Voroninski, “Phase retrieval via matrix completion,” SIAM Rev. 57, 225–251 (2015).
[Crossref]

E. J. Candes, T. Strohmer, and V. Voroninski, “Phaselift: Exact and stable signal recovery from magnitude measurements via convex programming,” Commun. on Pure Appl. Math. 66, 1241–1274 (2013).
[Crossref]

Strüder, L.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Strüdera, L.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Svenda, M.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Szöke, A.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Teng, D.

Y. Rivenson, Y. Zhang, H. Günaydın, D. Teng, and A. Ozcan, “Phase recovery and holographic image reconstruction using deep learning in neural networks,” Light. Sci. & Appl. 7, 17141 (2018).
[Crossref]

Terwilliger, T. C.

P. D. Adams, P. V. Afonine, R. W. Grosse-Kunstleve, R. J. Read, J. S. Richardson, D. C. Richardson, and T. C. Terwilliger, “Recent developments in phasing and structure refinement for macromolecular crystallography,” Curr. Opin. Struct. Biol. 19, 566–572 (2009).
[Crossref] [PubMed]

Thibault, P.

P. Thibault, V. Elser, C. Jacobsen, D. Shapiro, and D. Sayre, “Reconstruction of a yeast cell from x-ray diffraction data,” Acta Crystallogr. A 62, 248–261 (2006).
[Crossref] [PubMed]

P. Thibault, V. Elser, C. Jacobsen, D. Shapiro, and D. Sayre, “Reconstruction of a yeast cell from x-ray diffraction data,” Acta Crystallogr. A 62, 248–261 (2006).
[Crossref] [PubMed]

Timneanu, N.

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Tobias, H.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Treusch, R.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Tschentscher, T.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Ullrich, J.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

van der Schot, G.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

Van Der Spoel, D.

F. R. Maia, T. Ekeberg, D. Van Der Spoel, and J. Hajdu, “Hawk: the image reconstruction package for coherent x-ray diffractive imaging,” J. Appl. Crystallogr. 43, 1535–1539 (2010).
[Crossref]

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Vartanyants, I. A.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

Voroninski, V.

E. J. Candes, Y. C. Eldar, T. Strohmer, and V. Voroninski, “Phase retrieval via matrix completion,” SIAM Rev. 57, 225–251 (2015).
[Crossref]

E. J. Candes, T. Strohmer, and V. Voroninski, “Phaselift: Exact and stable signal recovery from magnitude measurements via convex programming,” Commun. on Pure Appl. Math. 66, 1241–1274 (2013).
[Crossref]

Wakatsuki, S.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

Waldspurger, I.

I. Waldspurger, A. d’Aspremont, and S. Mallat, “Phase recovery, maxcut and complex semidefinite programming,” Math. Program. 149, 47–81 (2015).
[Crossref]

Weidenspointner, G.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Weierstall, U.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

S. Marchesini, H. He, H. N. Chapman, S. P. Hau-Riege, A. Noy, M. R. Howells, U. Weierstall, and J. C. Spence, “X-ray image reconstruction from a diffraction pattern alone,” Phys. Rev. B 68, 140101 (2003).
[Crossref]

S. Marchesini, H. Chapman, A. Barty, C. Cui, M. Howells, J. Spence, U. Weierstall, and A. Minor, “Phase aberrations in diffraction microscopy,” arXiv preprint physics/0510033 (2005).

Weis, W. I.

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

Westphal, D.

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Wetzstein, G.

L. Shi, G. Wetzstein, and T. J. Lane, “A flexible phase retrieval framework for flux-limited coherent x-ray imaging,” arXiv preprint arXiv:1606.01195 (2016).

White, T. A.

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

Williams, G.

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Williams, G. J.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

A. Hosseinizadeh, G. Mashayekhi, J. Copperman, P. Schwander, A. Dashti, R. Sepehr, R. Fung, M. Schmidt, C. H. Yoon, B. G. Hogue, G. J. Williams, A. Aquila, and A. Ourmazd, “Conformational landscape of a virus by single-particle x-ray scattering,” Nat. Methods 14, 877–881 (2017).
[Crossref] [PubMed]

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

S. Boutet and G. J. Williams, “The coherent X-ray imaging (CXI) instrument at the Linac Coherent Light Source (LCLS),” New J. Phys. 12, 035024 (2010).
[Crossref]

Woods, B. W.

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Xavier, P. L.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Xu, R.

B. Leshem, R. Xu, Y. Dallal, J. Miao, B. Nadler, D. Oron, N. Dudovich, and O. Raz, “Direct single-shot phase retrieval from the diffraction pattern of separated objects,” Nat. Commun. 7, 10820 (2016).
[Crossref] [PubMed]

J. A. Rodriguez, R. Xu, C.-C. Chen, Y. Zou, and J. Miao, “Oversampling smoothness: an effective algorithm for phase retrieval of noisy diffraction intensities,” J. Appl. Crystallogr. 46, 312–318 (2013).
[Crossref] [PubMed]

Yagle, A. E.

A. E. Yagle, “Non-iterative phase retrieval from magnitude of complex-valued compact-support images,” Tech. rep., University of Michigan (2009).

Ye, Y.

M. Grant, S. Boyd, and Y. Ye, “CVX: Matlab software for disciplined convex programming,” (2008).

Yoon, C. H.

A. Hosseinizadeh, G. Mashayekhi, J. Copperman, P. Schwander, A. Dashti, R. Sepehr, R. Fung, M. Schmidt, C. H. Yoon, B. G. Hogue, G. J. Williams, A. Aquila, and A. Ourmazd, “Conformational landscape of a virus by single-particle x-ray scattering,” Nat. Methods 14, 877–881 (2017).
[Crossref] [PubMed]

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Zhang, Y.

Y. Rivenson, Y. Zhang, H. Günaydın, D. Teng, and A. Ozcan, “Phase recovery and holographic image reconstruction using deep learning in neural networks,” Light. Sci. & Appl. 7, 17141 (2018).
[Crossref]

Zou, Y.

J. A. Rodriguez, R. Xu, C.-C. Chen, Y. Zou, and J. Miao, “Oversampling smoothness: an effective algorithm for phase retrieval of noisy diffraction intensities,” J. Appl. Crystallogr. 46, 312–318 (2013).
[Crossref] [PubMed]

Zwart, P. H.

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Acta Crystallogr. A (2)

P. Thibault, V. Elser, C. Jacobsen, D. Shapiro, and D. Sayre, “Reconstruction of a yeast cell from x-ray diffraction data,” Acta Crystallogr. A 62, 248–261 (2006).
[Crossref] [PubMed]

P. Thibault, V. Elser, C. Jacobsen, D. Shapiro, and D. Sayre, “Reconstruction of a yeast cell from x-ray diffraction data,” Acta Crystallogr. A 62, 248–261 (2006).
[Crossref] [PubMed]

Appl. Opt. (1)

Bell Syst. Tech. J. (1)

D. Slepian, “Prolate spheroidal wave functions, fourier analysis, and uncertainty—V: The discrete case,” Bell Syst. Tech. J. 57, 1371–1430 (1978).
[Crossref]

Commun. on Pure Appl. Math. (1)

E. J. Candes, T. Strohmer, and V. Voroninski, “Phaselift: Exact and stable signal recovery from magnitude measurements via convex programming,” Commun. on Pure Appl. Math. 66, 1241–1274 (2013).
[Crossref]

Curr. Opin. Struct. Biol. (1)

P. D. Adams, P. V. Afonine, R. W. Grosse-Kunstleve, R. J. Read, J. S. Richardson, D. C. Richardson, and T. C. Terwilliger, “Recent developments in phasing and structure refinement for macromolecular crystallography,” Curr. Opin. Struct. Biol. 19, 566–572 (2009).
[Crossref] [PubMed]

IEEE Signal Process. Mag. (1)

Y. Shechtman, Y. C. Eldar, O. Cohen, H. N. Chapman, J. Miao, and M. Segev, “Phase retrieval with application to optical imaging: a contemporary overview,” IEEE Signal Process. Mag. 32, 87–109 (2015).
[Crossref]

IEEE Transactions on Signal Process. (1)

K. Huang, Y. C. Eldar, and N. D. Sidiropoulos, “Phase retrieval from 1D fourier measurements: Convexity, uniqueness, and algorithms,” IEEE Transactions on Signal Process. 64, 6105–6117 (2016).
[Crossref]

Inverse Probl. (1)

D. R. Luke, “Relaxed averaged alternating reflections for diffraction imaging,” Inverse Probl. 21, 37–50 (2004).
[Crossref]

J. Appl. Crystallogr. (3)

J. A. Rodriguez, R. Xu, C.-C. Chen, Y. Zou, and J. Miao, “Oversampling smoothness: an effective algorithm for phase retrieval of noisy diffraction intensities,” J. Appl. Crystallogr. 46, 312–318 (2013).
[Crossref] [PubMed]

F. R. Maia, T. Ekeberg, D. Van Der Spoel, and J. Hajdu, “Hawk: the image reconstruction package for coherent x-ray diffractive imaging,” J. Appl. Crystallogr. 43, 1535–1539 (2010).
[Crossref]

M. F. Hantke, T. Ekeberg, and F. R. Maia, “Condor: a simulation tool for flash x-ray imaging,” J. Appl. Crystallogr. 49, 1356–1362 (2016).
[Crossref] [PubMed]

J. Opt. Soc. Am. A (1)

Light. Sci. & Appl. (1)

Y. Rivenson, Y. Zhang, H. Günaydın, D. Teng, and A. Ozcan, “Phase recovery and holographic image reconstruction using deep learning in neural networks,” Light. Sci. & Appl. 7, 17141 (2018).
[Crossref]

Math. Program. (1)

I. Waldspurger, A. d’Aspremont, and S. Mallat, “Phase recovery, maxcut and complex semidefinite programming,” Math. Program. 149, 47–81 (2015).
[Crossref]

Math. Program. Comput. (1)

S. R. Becker, E. J. Candès, and M. C. Grant, “Templates for convex cone problems with applications to sparse signal recovery,” Math. Program. Comput. 3, 165–218 (2011).
[Crossref]

Nat. Commun. (1)

B. Leshem, R. Xu, Y. Dallal, J. Miao, B. Nadler, D. Oron, N. Dudovich, and O. Raz, “Direct single-shot phase retrieval from the diffraction pattern of separated objects,” Nat. Commun. 7, 10820 (2016).
[Crossref] [PubMed]

Nat. Methods (1)

A. Hosseinizadeh, G. Mashayekhi, J. Copperman, P. Schwander, A. Dashti, R. Sepehr, R. Fung, M. Schmidt, C. H. Yoon, B. G. Hogue, G. J. Williams, A. Aquila, and A. Ourmazd, “Conformational landscape of a virus by single-particle x-ray scattering,” Nat. Methods 14, 877–881 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Nat. Photonics (1)

M. F. Hantke, D. Hasse, F. R. N. C. Maia, T. Ekeberg, K. John, M. Svenda, N. D. Loh, A. V. Martin, N. Timneanu, D. S. Larsson, G. van der Schot, G. H. Carlsson, M. Ingelman, J. Andreasson, D. Westphal, M. Liang, F. Stellato, D. P. DePonte, R. Hartmann, N. Kimmel, R. A. Kirian, M. M. Seibert, K. Mühlig, S. Schorb, K. Ferguson, C. Bostedt, S. Carron, J. D. Bozek, D. Rolles, A. Rudenko, S. Epp, H. N. Chapman, A. Barty, J. Hajdu, and I. Andersson, “High-throughput imaging of heterogeneous cell organelles with an X-ray laser,” Nat. Photonics 8, 943–949 (2014).
[Crossref]

Nat. Phys. (1)

H. N. Chapman, A. Barty, M. J. Bogan, S. Boutet, M. Frank, S. P. Hau-Riege, S. Marchesini, B. W. Woods, S. Bajt, H. Benner, R. A. London, E. Ploenjes, M. Kuhlmann, R. Treusch, S. Duesterer, T. Tschentscher, J. R. Schneider, E. Spiller, T. Moeller, C. Bostedt, M. Hoener, D. A. Shapiro, K. O. Hodgson, D. van der Spoel, M. Bergh, C. Caleman, G. Huldt, M. Seibert, F. Maia, R. W. Lee, A. Szöke, N. Timneanu, and J. Hajdu, “Femtosecond diffractive imaging with a soft-x-ray free-electron laser,” Nat. Phys. 2, 839–843 (2006).
[Crossref]

Nature (2)

M. M. Seibert, T. Ekeberg, F. R. Maia, M. Svenda, J. Andreasson, O. Jönsson, D. Odić, B. Iwan, A. Rocker, D. Westphal, M. Hantke, D. P. DePonte, A. Barty, J. Schulz, L. Gumprecht, N. Coppola, A. Aquila, M. Liang, T. A. White, A. Martin, C. Caleman, S. Stern, C. Abergel, V. Seltzer, J.-M. M. Claverie, C. Bostedt, J. D. Bozek, S. Boutet, A. A. Miahnahri, M. Messerschmidt, J. Krzywinski, G. Williams, K. O. Hodgson, M. J. Bogan, C. Y. Hampton, R. G. Sierra, D. Starodub, I. Andersson, S. Bajt, M. Barthelmess, J. C. Spence, P. Fromme, U. Weierstall, R. Kirian, M. Hunter, R. B. Doak, S. Marchesini, S. P. Hau-Riege, M. Frank, R. L. Shoeman, L. Lomb, S. W. Epp, R. Hartmann, D. Rolles, A. Rudenko, C. Schmidt, L. Foucar, N. Kimmel, P. Holl, B. Rudek, B. Erk, A. Hömke, C. Reich, D. Pietschner, G. Weidenspointner, L. Strüder, G. Hauser, H. Gorke, J. Ullrich, I. Schlichting, S. Herrmann, G. Schaller, F. Schopper, H. Soltau, K.-U. U. Kühnel, R. Andritschke, C.-D. D. Schröter, F. Krasniqi, M. Bott, S. Schorb, D. Rupp, M. Adolph, T. Gorkhover, H. Hirsemann, G. Potdevin, H. Graafsma, B. Nilsson, H. N. Chapman, and J. Hajdu, “Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser,” Nature 470, 78–81 (2011).
[Crossref] [PubMed]

K. S. Raines, S. Salha, R. L. Sandberg, H. Jiang, J. A. Rodríguez, B. P. Fahimian, H. C. Kapteyn, J. Du, and J. Miao, “Three-dimensional structure determination from a single view,” Nature 463, 214 (2010).
[Crossref]

New J. Phys. (1)

S. Boutet and G. J. Williams, “The coherent X-ray imaging (CXI) instrument at the Linac Coherent Light Source (LCLS),” New J. Phys. 12, 035024 (2010).
[Crossref]

Phys. Rev. B (2)

J. Miao, T. Ishikawa, E. H. Anderson, and K. O. Hodgson, “Phase retrieval of diffraction patterns from noncrystalline samples using the oversampling method,” Phys. Rev. B 67, 174104 (2003).
[Crossref]

S. Marchesini, H. He, H. N. Chapman, S. P. Hau-Riege, A. Noy, M. R. Howells, U. Weierstall, and J. C. Spence, “X-ray image reconstruction from a diffraction pattern alone,” Phys. Rev. B 68, 140101 (2003).
[Crossref]

Phys. Rev. E (1)

N.-T. D. Loh, S. Eisebitt, S. Flewett, and V. Elser, “Recovering magnetization distributions from their noisy diffraction data,” Phys. Rev. E 82, 061128 (2010).
[Crossref]

Phys. Rev. Lett. (2)

T. Ekeberg, M. Svenda, C. Abergel, F. R. N. C. Maia, V. Seltzer, J.-M. Claverie, M. Hantke, O. Jönsson, C. Nettelblad, G. van der Schot, M. Liang, D. P. DePonte, A. Barty, M. M. Seibert, B. Iwan, I. Andersson, N. D. Loh, A. V. Martin, H. Chapman, C. Bostedt, J. D. Bozek, K. R. Ferguson, J. Krzywinski, S. W. Epp, D. Rolles, A. Rudenko, R. Hartmann, N. Kimmel, and J. Hajdu, “Three-dimensional reconstruction of the giant mimivirus particle with an x-ray free-electron laser,” Phys. Rev. Lett. 114, 098102 (2015).
[Crossref] [PubMed]

R. P. Kurta, J. J. Donatelli, C. H. Yoon, P. Berntsen, J. Bielecki, B. J. Daurer, H. DeMirci, P. Fromme, M. F. Hantke, F. R. N. C. Maia, A. Munke, C. Nettelblad, K. Pande, H. K. N. Reddy, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, M. Svenda, G. van der Schot, I. A. Vartanyants, G. J. Williams, P. L. Xavier, A. Aquila, P. H. Zwart, and A. P. Mancuso, “Correlations in scattered x-ray laser pulses reveal nanoscale structural features of viruses,” Phys. Rev. Lett. 119, 158102 (2017).
[Crossref] [PubMed]

Proc. SPIE (1)

A. V. Martin, J. Andreasson, A. Aquila, S. Bajt, T. R. M. Barends, M. Barthelmess, A. Barty, W. H. Benner, C. Bostedt, J. D. Bozek, P. Bucksbaum, C. Caleman, N. Coppola, D. P. DePonte, T. Ekeberg, S. W. Epp, B. Erk, G. R. Farquar, H. Fleckenstein, L. Foucar, M. Frank, L. Gumprecht, C. Y. Hampton, M. Hantke, A. Hartmann, E. Hartmann, R. Hartmann, S. P. Hau-Riege, G. Hauser, P. Holl, A. Hoemke, O. Jönsson, S. Kassemeyer, N. Kimmel, M. Kiskinova, F. Krasniqi, J. Krzywinski, M. Liang, N.-T. D. Loh, L. Lomb, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, M. Messerschmidt, K. Nass, D. Odic, E. Pedersoli, C. Reich, D. Rolles, B. Rudek, A. Rudenko, C. Schmidt, J. Schultz, M. M. Seibert, R. L. Shoeman, R. G. Sierra, H. Soltau, D. Starodub, J. Steinbrener, F. Stellato, L. Strüdera, M. Svenda, H. Tobias, J. Ullrich, G. Weidenspointner, D. Westphal, T. A. White, G. Williams, J. Hajdu, I. Schlichting, M. J. Bogan, and H. N. Chapman, “Single particle imaging with soft x-rays at the linac coherent light source,” Proc. SPIE 8078, 807–809 (2011).

Rev. Sci. Instruments (1)

S. Marchesini, “Invited article: A unified evaluation of iterative projection algorithms for phase retrieval,” Rev. Sci. Instruments 78, 011301 (2007).
[Crossref]

SIAM Rev. (1)

E. J. Candes, Y. C. Eldar, T. Strohmer, and V. Voroninski, “Phase retrieval via matrix completion,” SIAM Rev. 57, 225–251 (2015).
[Crossref]

Struct. Dyn. (1)

A. Aquila, A. Barty, C. Bostedt, S. Boutet, G. Carini, D. dePonte, P. Drell, S. Doniach, K. H. Downing, T. Earnest, H. Elmlund, V. Elser, M. Gühr, J. Hajdu, J. Hastings, S. P. Hau-Riege, Z. Huang, E. E. Lattman, F. R. N. C. Maia, S. Marchesini, A. Ourmazd, C. Pellegrini, R. Santra, I. Schlichting, C. Schroer, J. C. H. Spence, I. A. Vartanyants, S. Wakatsuki, W. I. Weis, and G. J. Williams, “The Linac Coherent Light Source single particle imaging road map,” Struct. Dyn. 2, 041701 (2015).
[Crossref]

Other (10)

Y. Nesterov, Introductory Lectures on Convex Optimization: A Basic Course, vol. 87 (Springer Science & Business Media, 2013).

J. Löfberg, “YALMIP: A toolbox for modeling and optimization in MATLAB,” in Computer Aided Control Systems Design, 2004 IEEE International Symposium on, (IEEE, 2004), pp. 284–289.
[Crossref]

MOSEK ApS, The MOSEK Optimization Toolbox for MATLAB Manual. Version 8.1. (2017).

M. Grant, S. Boyd, and Y. Ye, “CVX: Matlab software for disciplined convex programming,” (2008).

C. F. Bohren and D. R. Huffman, Absorption and Scattering of Light by Small Particles (Wiley-Blackwell, 2007), chap. 4, pp. 82–129.
[Crossref]

S. Becker, E. Candes, and M. Grant, Templates for First-Order Conic Solvers User Guide 1.3 (2013).

L. Shi, G. Wetzstein, and T. J. Lane, “A flexible phase retrieval framework for flux-limited coherent x-ray imaging,” arXiv preprint arXiv:1606.01195 (2016).

V. Elser, T.-Y. Lan, and T. Bendory, “Benchmark problems for phase retrieval,” arXiv preprint arXiv:1706.00399 (2017).

A. E. Yagle, “Non-iterative phase retrieval from magnitude of complex-valued compact-support images,” Tech. rep., University of Michigan (2009).

S. Marchesini, H. Chapman, A. Barty, C. Cui, M. Howells, J. Spence, U. Weierstall, and A. Minor, “Phase aberrations in diffraction microscopy,” arXiv preprint physics/0510033 (2005).

Cited By

OSA participates in Crossref's Cited-By Linking service. Citing articles from OSA journals and other participating publishers are listed here.

Alert me when this article is cited.


Figures (4)

Fig. 1
Fig. 1 Simulated particle with and without Hann window apodization. a) Original simulated diffraction pattern with high-density sphere. b) Central region of discrete Fourier transform of a), showing the particle. c) The image in b) with limited range to showcase artifacts outside of the object outline. d) The simulated pattern with Hann window applied, resulting in lower intensity away from the center. e) Discrete Fourier transform of pattern after apodization. Slight blur visible. f) The image in e) with limited range. Artifacts found in c) mostly absent.
Fig. 2
Fig. 2 10 phased reconstructions of sparse patterns based on the simulated particle, each with approximately 10,000 photons, with different phase retrieval schemes compared against the true noiseless reference image. The methods include two cases using our COACS pre-processing, with Hybrid Input-Output and Oversampling Smoothness. The same methods were tried without COACS as well, plus Speckle Healing, since the additional constraint in that method is in theory equivalent to COACS. The final two cases verify the behavior when the apodizing Hann window is not applied. Example of an actual input pattern is shown in Fig. 3. Each picture is an aligned average of the 10 best individual phasings out of 100 replicates for each combination of phasing method and sampled image.
Fig. 3
Fig. 3 Diffraction pattern results for the first random instance (rescaled to undo Hann window apodization). a) Original simulated pattern. b) Poisson sampling with simulated 25x25 beamstop, giving only 10,000 non-masked photons. c) Average diffraction pattern over 10 best phasings. Artifacts at the edges, reproduction of original features dropping off quickly. d) Average diffraction pattern over 10 best phasings based on COACS healing. Features reproduced to higher angles, but still problems at the edge, missing the outer ring. e) Diffraction pattern resulting directly from the COACS healing. Artifacts present in d) are absent. Outer ring corresponding to the one found in original pattern. f) Average based on the separate healing results of all 50 sampled particles. Errors cancel out, resulting in a pattern very similar to a).
Fig. 4
Fig. 4 R factors (normalized relative L1 error) for various radius shells in pixels. Curves are averages over the individually computed results for all 50 simulated particles. Comparison between results based on average phasing of 10 best reconstructions of original pattern, average phasing of 10 best reconstructions of COACS-healed pattern, and using the structural factors from the COACS pattern directly. COACS-healing reduces phasing errors, but the phasing step is still a significant contributor to errors. OSS is competitive with HIO overall, but fails at reproducing correct signal at the lowest frequencies, which also contributes to the higher MSE error for that method. Speckle Healing, which theoretically implements the same autocorrelation constraint as COACS, improves results over pure HIO, but does not come near HIO + COACS. COACS peak at around 90 pixels is due to the R factor being a relative error metric. This is the location of a minimum due to the shape of the small spherical feature. Hence, absolute errors of the same magnitude are amplified.

Tables (1)

Tables Icon

Table 1 Pattern R factors and image mean-square errors.

Equations (28)

Equations on this page are rendered with MathJax. Learn more.

X ( P )
X ( P )
W i , j = 0.25 ( 1 cos ( 2 π i N ) ) ( 1 cos ( 2 π j N ) ) 0 i < N , 0 j < N
X = ( P W )
B = Poisson ( r X X ¯ )
{ r X X ¯ = B P ( 1 S ) = 0
( Y ) = ( X X ¯ ) = P * P ¯
S ^ = 1 ( S * S )
P ^ = P * P ¯
{ r Y = B P ^ ( 1 S ^ ) = 0
minimize log p ( Y ; μ ) + λ Tr ( Z ) subject to μ = 𝒜 ( Z ) , Z 0
ϕ ( X ) = f ( 𝒜 ( X ) + b ) + h ( X )
X opt . = arg min X ϕ ( X )
Φ h ( X , t ) = arg min Z h ( z ) + 1 2 t 1 Z X 2 2
f ( x ) f ( x + d ) L d
Y = ( P ^ )
Y = Y 0 + Y = ( P ^ 0 ) + ( P ^ )
f i ( y i ) = y i k i log ( y i )
f ( Y ) = f i ( y i )
f ( Y 0 + Y ) = f i ( y i 0 + y i )
f ( Y ) = f i ( y i 0 + y i ) f i ( y i 0 )
f i ( Y i ) = { Y i B i log Y i Y i > l l B i log l + ( 1 1 / l ) ( Y i l ) + 1 2 l ( Y i l ) 2 Y i l
l i max ( 1 w i 2 , 1 W i 2 B i ) f ^ i ( Y i ) { Y i B i log Y i Y i > l i l i B i log l i + ( 1 1 / l i ) ( Y i l i ) + 1 2 l ( Y i l i ) 2 Y i l i f ^ ( Y ) = f ^ i ( Y i 0 + Y i w i ) f ^ i ( Y i 0 W i 2 )
h ( P ^ i ) = c | P ^ i ( 1 S ^ i ) | 2
h ( P ^ ) = i h ( P ^ i )
S ^ W = 1 ( W ( S ^ ) )
h W ( P ^ i ) = c | P ^ i ( 1 S ^ i W ) | 2
h W ( P ^ ) = i h W ( P ^ i )

Metrics